先天性巨結(jié)腸需切除病變腸管，包括遠端無神經(jīng)節(jié)細胞腸段、近端或極度擴張肥厚腸管，所以根治手術(shù)為治療先天性巨結(jié)腸最好的方法。根治手術(shù)并不是一出生即可進行，要考慮麻醉風(fēng)險、患者對手術(shù)的耐受性以及巨結(jié)腸疾病對患兒的影響。 根治性手術(shù)之前應(yīng)維持患兒正常排便、正常生長發(fā)育，需要用非手術(shù)治療方法，甚至腸造瘺方法進行治療。保守治療包括應(yīng)用開塞露、肥皂條通便、手指或者擴肛器擴肛治療。然后用乳果糖等緩瀉劑增加糞便中的水分，以及洗腸治療；也可以通過中醫(yī)中藥、針灸方法，促進腸道蠕動、吸收、排便。 非手術(shù)治療無效、病變腸管長度長、有嚴(yán)重巨結(jié)腸同源病或者合并巨結(jié)腸小腸結(jié)腸炎的患者，可以先做腸造瘺手術(shù)，延期進行根治性手術(shù)。超短段型巨結(jié)腸病變腸管短，距離肛門口只有2-3cm，可以通過強力擴肛或者部分內(nèi)括約肌切除的方法進行治療，治療效果較好。