肝臟的解剖結構除肝實質本身，還包括血管系統和膽管系統。在血管系統中又分為肝動脈系統、門靜脈系統，還有肝靜脈系統。其中肝門靜脈系統是腸道及脾臟的回流血液，由脾靜脈、腸系膜上靜脈和腸系膜下靜脈匯合而成，形成門靜脈后進入肝臟。門靜脈系統的位置是在肝門，即門靜脈入肝位置。肝門處是肝臟門靜脈主干，主干遠端由脾靜脈和腸系膜上靜脈匯合而成，處于肝臟胃和脾間。另外，腸系膜上靜脈是在腸系膜階段由腸系膜靜脈分支匯合而形成腸系膜上腔靜脈。腸系膜下靜脈與腸系膜上靜脈匯合后再與脾靜脈會合，結合成門靜脈主干后入肝。