原發(fā)性頭痛的發(fā)病機(jī)制、病因，至今還不是特別的清楚，主要有以下的幾種假說和推論：1、遺傳因素：某些原發(fā)性頭痛可能是由于基因的突變導(dǎo)致，即存在有家族史，最經(jīng)典的是家族性的偏頭痛；2、環(huán)境因素以及社會應(yīng)激心理因素：比如慢性緊張性頭痛，通常是由于環(huán)境的改變、生活不適應(yīng)、工作壓力過大，以及焦慮、抑郁情緒，與這些關(guān)系比較大；3、組織胺釋放學(xué)說：主要指的是叢集性頭痛，叢集性頭痛的患者與組胺的過度釋放可能有一定的關(guān)系，而叢集性頭痛又叫做組胺相關(guān)性頭痛；4、內(nèi)分泌紊亂學(xué)說：有部分頭痛的患者通常發(fā)生在更年期40-50歲，這部分頭痛的患者可能與內(nèi)分泌失調(diào)、激素調(diào)節(jié)水平紊亂有一定的關(guān)系；5、心源性因素：特指的是一些伴有視覺先兆的偏頭痛患者，尤其是有視覺先兆的偏頭痛，有的時候病因與卵圓孔未閉、心臟結(jié)構(gòu)缺陷有關(guān)系。如果是做了卵圓孔的封堵手術(shù)，頭痛可以明顯減少，甚至不發(fā)，也是比較嶄新的機(jī)制。當(dāng)然還有很多的機(jī)制，目前正在研究、正在探討，還不是特別的明確。