感染性疾病的病原體種類較多，包括各種細菌、病毒、支原體、衣原體等。病原體不同，檢查方法也不盡相同。以病毒感染為例，乙型病毒性肝炎的檢測指標包括乙肝兩對半（表面抗原、表面抗體、核心抗體、e抗原、e抗體）和乙型肝炎病毒核酸；丙型病毒性肝炎的檢測指標為丙型肝炎病毒抗體；艾滋病的檢測指標為艾滋病病毒抗體等。