經(jīng)顱磁治療在臨床工作中已經(jīng)廣泛開展，主要對以下疾病有一定輔助治療作用：1、腦血管?。簾o論是缺血性腦血管病，還是出血性腦血管病，在慢性康復過程中用經(jīng)顱磁治療，都有一定幫助，可以改善已經(jīng)癱瘓的肢體、不會說話的語言功能，包括認知功能，都有一定療效；2、焦慮癥、抑郁癥：在此方面經(jīng)顱磁治療確實取得了一定卓越的療效，三管齊下指心理治療、藥物治療、經(jīng)顱磁治療，此3種治療方法是治療焦慮癥、抑郁癥的法寶；3、神經(jīng)系統(tǒng)的慢性變性病：包括癲癇、帕金森病、阿爾茨海默氏病以及其他慢性病，經(jīng)顱磁治療對上述疾病的治療也有一定的療效。