核酸檢測可以從口腔做，也可以從鼻子做。從口腔做的核酸檢測稱為口咽拭子，從鼻腔做的核酸檢測稱為鼻咽拭子，統稱為咽拭子。兩種拭子檢測采用拭子略有不同，鼻咽拭子更細長，從檢測的準確率上看，鼻咽拭子的準確率比口咽拭子更高，做口咽拭子時部分人會用舌頭抵擋，采到的標本不太準確，口咽拭子采集部位會更靠前，病毒核酸數量稍低，檢測敏感性低。鼻咽拭子是指從鼻子進入，直接到達咽喉部位，可以避免舌頭干擾，通常采集到的標本會更準確，由于采集部位更靠后，如果有病毒感染，病毒數量比前面更高，所以通過鼻咽拭子，檢測到的陽性率要高于口咽拭子。目前大部分做核酸檢測的機構，可以同時提供兩種檢測方法，通常首選鼻咽拭子檢測。