正常情況下，陰莖是在恥骨聯(lián)合前，突出于皮膚的柱狀器官。陰莖短小可能是自身發(fā)育小，或體內(nèi)結(jié)構(gòu)如肥胖、隱匿性陰莖等疾病而顯示變小。出現(xiàn)雄激素水平低下時，會導(dǎo)致陰莖短小，如卡爾曼氏綜合征。由先天性睪丸產(chǎn)生的雄激素減少，使陰莖發(fā)育受到限制。此外特殊結(jié)構(gòu)變化，如包莖、過于肥胖等因素，陰莖大多在皮膚下或筋膜下包埋，需要經(jīng)過手術(shù)干預(yù)。減肥后皮下脂肪組織變薄，陰莖突出體表顯示增大。另外先天疾病如尿道下裂、隱匿陰莖等先天發(fā)育不足，疾病造成陰莖短小而且彎曲。有時伴隨尿道不發(fā)育，引起尿道下裂時，需要手術(shù)治療。對于肥胖患者，需要通過減肥后，陰莖自然顯示變大。對于先天性發(fā)育不全，如卡爾曼氏綜合征，是先天性下丘腦分泌的激素不足，需要內(nèi)分泌的干預(yù)治療。對于疾病如隱匿陰莖、尿道下裂，需要通過手術(shù)干預(yù)，改變和矯正陰莖的大小。