肛瘺主要在肛門(mén)周?chē)?，分高位和低位。如果是高位肛瘺，在直腸深間隙、直腸后深間隙和坐骨直腸間隙、骨盆直腸間隙，即肛門(mén)周?chē)畈俊? 如果是低位肛瘺，比較表淺，可能在皮下或在淺括約肌間走行。有的肛瘺比較長(zhǎng)，有的肛瘺比較短，短的外口距肛門(mén)可能1-2cm，長(zhǎng)的肛瘺外口距肛門(mén)可達(dá)到10cm，甚至20cm。另外，還有直肛瘺和彎曲肛瘺之分，例如肛瘺外口在右側(cè)，但內(nèi)口在肛門(mén)后側(cè)，屬于馬蹄形肛瘺。肛瘺位置主要以肛門(mén)為中心，環(huán)繞著肛門(mén)，在四周分布。