頭疼可以就診的科室如下：1、心內科或神經內科：患有頭疼首先要關注的是心腦血管疾病，建議就診于心內科或神經內科，需要關注頭顱本身的問題。如果有頭顱占位性病變，如小腦腦干腫瘤、血管畸形、血管瘤、腦出血等，需要頭顱核磁共振檢查來進行篩查，必要時進行腦CTA檢查。心臟疾病要關注由于高血壓、動脈粥樣硬化導致的心臟疾病，如心律失常、心力衰竭等等，建議到心臟科進行酶學檢查以及心電圖、心臟彩超等檢查；2、疼痛科：如果心腦血管都沒有問題，頭疼建議就診于疼痛科，因為頭疼一般是由于頸椎病、頸肩部軟組織損害刺激頸神經產生的癥狀，所以就診于疼痛科進行頸椎核磁共振檢查。其目的在于排除延髓梗死和其它病變，以及椎體病變等。如果只是頸椎曲度改變，椎間盤突出、退變等等，沒有其它器質性病變，可以進行疼痛科的相關治療來治療頭疼。