尿尿陰莖疼的原因如下： 1、淋球菌性尿道炎：尿尿陰莖疼最常見于淋球菌性尿道炎，俗稱淋病，淋菌性尿道炎病人由于感染性致病菌刺激尿道黏膜，會導致黏膜水腫糜爛，還會導致黏膜出現水泡、膿皰，破裂后會形成潰瘍面。病人在排尿時，會出現尿道刺痛和尿道疼痛癥狀，還會出現尿道口膿性分泌物；2、后尿道結石：病人出現后尿道結石時，結石經常導致尿道膜部，或尿道球部崁頓，容易引起尿痛癥狀。通常在排尿時陰莖疼痛明顯，多數病人還會伴有血尿癥狀；3、陰莖硬結癥：病人通常在海綿體白膜處形成硬結改變，由于局部炎癥，導致白膜局部纖維化，形成局部硬結，在排尿時也會出現陰莖疼痛癥狀。病人出現尿尿時陰莖疼癥狀時，應及時到泌尿外科，或男科就醫(yī)，通過規(guī)范的檢查和治療，多數病人尿尿時陰莖疼癥狀會明顯好轉。